Cơ cấu tổ chức của Bộ Giáo dục và Đào tạo từ 23 đơn vị giảm xuống còn 18, trong đó 15 đơn vị giúp bộ trưởng thực hiện chức năng quản lý Nhà nước; ba đơn vị phục vụ chức năng quản lý Nhà nước của bộ.