Bệnh nhân mắc COVID-19 ở TP Hồ Chí Minh nhiễm biến chủng Ấn Độ
Bệnh nhân 4514 (nam, 35 tuổi, ngụ tại chung cư SunView Town, thành phố Thủ Đức, TP Hồ Chí Minh) có kết quả giải trình gene nhiễm SARS- CoV-2 biến chủng Ấn Độ, đây là chủng đang lưu hành tại các tỉnh phía Bắc.
Chiều 19/5, Trung tâm Kiểm soát Bệnh tật TP Hồ Chí Minh cho biết, qua kết quả giải trình tự gene của nhóm nghiên cứu COVID-19 của Bệnh viện Bệnh Nhiệt Đới và Đơn vị Nghiên cứu Lâm Sàng Đại Học Oxford cho thấy, BN 4514 nhiễm SARS-CoV-2 biến chủng Ấn Độ B.1.617.2.
Theo báo cáo của nhóm nghiên cứu, nhóm đã sử dụng mẫu RNA được tách chiết từ mẫu phết hầu họng của bệnh nhân 4514 vào ngày 18/5, thực hiện giải mã gene bằng kỹ thuật Illumina MiSeq và MinION, với phần mềm lắp ghép bộ gene Genious.
Kết quả định danh bằng phần mềm Pangolin cho thấy, bộ gene thu được thuộc biến chủng B.1.617.2. Kết quả xác định đột biến bằng COV-GLUE ghi nhận, bộ gene mang 6 đột biến thay đổi aminoacid tiêu biểu (T19R, L452R, T478K, D614G, P681R, D950N) và một đột biến đứt đoạn (156-158) trên vùng protein gai của biến chủng B.1.617.2.
Điều này đưa đến kết luận, BN 4514 nhiễm biến chủng B.1.617.2 tương tự biến chủng đang gây dịch tại một số nơi ở phía Bắc.
Liên quan đến BN 4514, còn có trường hợp nhiễm đã được xác định (đang đợi Bộ Y tế công bố) cư ngụ tại Quận 7. Hai người cùng làm việc chung trong một đội 8 người tại một phòng làm việc trong công ty Grove, đường Pasteur, Quận 3. Bệnh nhân cư ngụ tại Quận 7, theo lời khai, đã rời khỏi TP Hồ Chí Minh từ ngày 24/4 đi Hải Phòng và trở về thành phố ngày 5/5 trên chuyến bay đi VN1179 từ Hải Phòng đến TP Hồ Chí Minh. Bệnh nhân có dấu hiệu sốt, tự mua thuốc uống vào ngày 8/5.
Căn cứ kết quả dấu hiệu lâm sàng, yếu tố dịch tễ và xét nghiệm thì có nhiều chứng cứ cho thấy bệnh nhân 4514 bị lây từ bệnh nhân cư ngụ tại Quận 7.
Trung tâm Kiểm soát Bệnh tật TP Hồ Chí Minh cho biết, do tình trạng của bệnh nhân ở Quận 7 đang trong quá trình hồi phục nên rất khó để thực hiện giải trình gene.