Sau một thời gian vận hành mô hình trường học sau sắp xếp, bên cạnh những kết quả bước đầu, tại một số địa phương đã bộc lộ những bất cập khi xuất hiện các trường có quy mô lớn, nhiều phân hiệu, điểm trường cách xa nhau, gây khó khăn cho công tác quản lý và tổ chức dạy học.
