Trong những năm gần đây, đê sông Cà Lồ thường xuyên xảy ra sự cố do mưa lũ. Thành phố Hà Nội đang chỉ đạo Sở Nông nghiệp và Môi trường, các xã ven sông triển khai nhiều dự án cải tạo, sửa chữa nhằm nâng cao năng lực ứng phó thiên tai cho tuyến sông.