Bên cạnh những mô hình thành công, hành trình xây dựng nông thôn sáng tạo ở Hà Nội vẫn còn không ít khó khăn. Tốc độ đô thị hóa nhanh, quỹ đất thu hẹp, hạ tầng chưa đồng bộ và thiếu nguồn nhân lực chất lượng cao đang là những thách thức hiện hữu.