Các đối tượng bị xác định đã sử dụng hai hệ thống sổ sách kế toán nhằm che giấu doanh thu bán hàng thực tế, gây thiệt hại cho ngân sách Nhà nước số tiền thuế giá trị gia tăng hơn 273 tỷ đồng.
Khi điều tra giai đoạn 2 vụ án Z Holding sản xuất hơn 4 triệu hộp sữa giả, cơ quan công an đã khởi tố thêm 14 người với cáo buộc giúp sức cho các nhóm cầm đầu gây thiệt hại về thuế 1.435 tỷ đồng.