Dự thảo Luật Tổ chức cơ quan điều tra hình sự (sửa đổi) đang đề xuất một thay đổi quan trọng trong phân định thẩm quyền điều tra giữa hai hệ thống cơ quan điều tra. Theo dự thảo luật, đối với các vụ án không thuộc bí mật quân sự, không xảy ra trong doanh trại Quân đội hoặc khu vực quân sự do Quân đội nhân dân quản lý, bảo vệ mà bị hại hoặc người phạm tội là quân nhân, Cơ quan điều tra Công an cấp tỉnh vẫn tiến hành điều tra toàn bộ vụ án; cơ quan điều tra trong Quân đội nhân dân chỉ thực hiện một số hoạt động điều tra theo yêu cầu, như xác minh nhân thân quân nhân, thi hành các biện pháp bắt, giữ người trong trường hợp khẩn cấp, khám xét, thu giữ vật chứng, tài liệu trong doanh trại hoặc khu vực quân sự.