Thi công ngầm Dự án tuyến đường sắt Bến Thành - Cần Giờ phải bảo đảm an toàn, bảo vệ quyền và lợi ích hợp pháp của người dân, tổ chức trong khu vực chịu ảnh hưởng. Trước khi thi công phải khảo sát, chụp ảnh, quay phim và kiểm định chất lượng toàn bộ nhà ở, công trình, tài sản trong vùng ảnh hưởng.