Kiểm soát chất lượng nông sản, đặc biệt là việc kinh doanh, sử dụng thuốc bảo vệ thực vật trong trồng trọt, có vai trò quan trọng trong bảo đảm ATTP đối với các sản phẩm rau, củ, quả. Hà Nội hiện có 100 xã, phường còn sản xuất nông nghiệp, với diện tích gieo trồng rau khoảng 33.000 ha mỗi năm. Nguồn cung lớn đặt ra yêu cầu phải kiểm soát chặt chẽ an toàn thực phẩm ngay từ khâu sản xuất.