Mặc dù mới được đưa vào vận hành từ tháng 4/2026, nhưng nhiều hạng mục thuộc Dự án Khu Nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao phát triển tôm Bạc Liêu đã xuất hiện tình trạng sụt lún, nứt tường, thấm dột và hỏng hóc thiết bị.