Dù đã có nhiều chủ trương, chính sách thúc đẩy khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo, nghiên cứu cơ bản trong lĩnh vực khoa học hạt nhân vẫn đối mặt với những hạn chế về nhân lực, cơ sở vật chất, kinh phí và cơ chế quản lý.