Bệnh viện dự kiến xây dựng hai khối nhà khám, chữa bệnh cao 7 tầng; khu điều trị bệnh truyền nhiễm và nhà lưu trú dành cho cán bộ, nhân viên cùng cao 3 tầng.
BQL Khu kinh tế tỉnh Hà Tĩnh chấp thuận quy hoạch tổng thể mặt bằng Bệnh viện Đa khoa Nam Kỳ Anh trên khu đất gần 3,85 ha, gồm các khối khám chữa bệnh cao 7 tầng cùng nhiều hạ tầng hiện đại.