Danh sách các đơn vị thuộc, trực thuộc Thanh tra Chính phủ
Theo Nghị định số 109/2025/NĐ-CP, Thanh tra Chính phủ gồm 22 đơn vị trong đó 20 đơn vị hành chính; 2 đơn vị sự nghiệp công lập.
Chính phủ ban hành Nghị định số 109/2025/NĐ-CP ngày 20/5/2025 quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Thanh tra Chính phủ.

Cơ cấu tổ chức mới của Thanh tra Chính phủ gồm 22 đơn vị
Theo Nghị định số 109/2025/NĐ-CP, Thanh tra Chính phủ gồm 22 đơn vị trong đó 20 đơn vị hành chính, giúp Tổng Thanh tra Chính phủ thực hiện chức năng quản lý nhà nước; 2 đơn vị sự nghiệp công lập, phục vụ chức năng quản lý nhà nước của Thanh tra Chính phủ.
20 đơn vị hành chính của Thanh tra Chính phủ gồm:
1- Vụ Pháp chế;
2- Vụ Tổ chức cán bộ;
3- Vụ Kế hoạch - Tài chính;
4- Văn phòng;
5- Vụ Hợp tác quốc tế;
6- Cục Thanh tra, giải quyết khiếu nại, tố cáo khu vực phía Bắc (Cục I);
7- Cục Thanh tra, giải quyết khiếu nại, tố cáo khu vực Miền Trung (Cục II);
8- Cục Thanh tra, giải quyết khiếu nại, tố cáo khu vực phía Nam (Cục III);
9- Cục Phòng, chống tham nhũng, lãng phí, tiêu cực (Cục IV);
10- Cục Thanh tra, giải quyết khiếu nại, tố cáo lĩnh vực nội chính, nội vụ, dân tộc, tôn giáo (Cục V);
11- Cục Thanh tra, giải quyết khiếu nại, tố cáo lĩnh vực tài chính, ngân hàng (Cục VI);
12- Cục Thanh tra, giải quyết khiếu nại, tố cáo lĩnh vực xây dựng (Cục VII);
13- Cục Thanh tra, giải quyết khiếu nại, tố cáo lĩnh vực nông nghiệp và môi trường (Cục VIII);
14- Cục Thanh tra, giải quyết khiếu nại, tố cáo lĩnh vực công thương (Cục IX);
15- Cục Thanh tra, giải quyết khiếu nại, tố cáo lĩnh vực y tế, giáo dục (Cục X);
16- Cục Thanh tra, giải quyết khiếu nại, tố cáo lĩnh vực văn hóa, thể thao, du lịch, ngoại giao (Cục XI);
17- Cục Thanh tra, giải quyết khiếu nại, tố cáo lĩnh vực khoa học và công nghệ (Cục XII);
18- Cục Giám sát và Thẩm định (Cục XIII);
19- Cục Theo dõi, đôn đốc và Xử lý sau thanh tra (Cục XIV); 20- Ban Tiếp công dân trung ương.
2 đơn vị sự nghiệp công lập của Thanh tra Chính phủ gồm: 1- Báo Thanh tra; 2- Trường Cán bộ thanh tra.
Nghị định nêu rõ Ban Tiếp công dân trung ương trực tiếp quản lý Trụ sở Tiếp công dân Trung ương tại Hà Nội và Thành phố Hồ Chí Minh.
Tổng Thanh tra Chính phủ quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của các đơn vị trực thuộc Thanh tra Chính phủ.
Nghị định này có hiệu lực thi hành từ ngày 1/6/2025. Nghị định này thay thế Nghị định số 81/2023/NĐ-CP ngày 27/11/2023 của Chính phủ quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Thanh tra Chính phủ và bãi bỏ, sửa đổi các quy định về thanh tra tại 13 Nghị định có liên quan.