Mặc dù nhiều lần lực lượng chức năng tiến hành mật phục truy bắt nhưng Nguyễn Quốc Tuấn vẫn bặt vô âm tín. Tuy nhiên, khi đối tượng vào đất liền để trú tránh bão số 3 thì đã bị cơ quan công bắt giữ thành công.
Nhận định nhiều khả năng đối tượng trốn truy nã 23 năm sẽ trở về đất liền để tránh trú bão, lãnh đạo Công an tỉnh Quảng Ninh đã cử Tổ công tác đặc biệt vào tỉnh Tiền Giang bắt giữ thành công khi đối tượng này vừa trở về đất liền.
Trong 23 năm lẩn trốn, đối tượng đã dùng nhiều thủ đoạn như: thay tên đổi họ, trốn ở những nơi hẻo lánh để tránh sự truy bắt của cơ quan Công an. Sau nhiều năm truy vết, đối tượng đã bị bắt khi vào bờ tránh bão số 3.