Sau vòng loại hấp dẫn từ tháng 3 đến 6-2020 với sự tham dự của 26 đội, chia làm 5 bảng đấu, 8 đội bóng xuất sắc nhất, là: U.19 Hoàng Anh Gia Lai 1, U.19 Hoàng Anh Gia Lai 2, U.19 Bình Dương, U.19 Sông Lam Nghệ An, U.19 An Giang, U.19 Công an nhân dân, U.19 TP Hồ Chí Minh và chủ nhà U.19 PVF đã góp mặt tại VCK U.19 quốc gia 2020, khởi tranh từ ngày 19 đến 28-6 tại Hưng Yên.
Sau khi U.19 HAGL 1 và B.Bình Dương sớm đoạt vé vào vòng chung kết (VCK), lượt trận cuối vòng loại U.19 quốc gia diễn ra gay cấn đến phút chót. Hồi sinh ở lượt về với 4 trận thắng liên tiếp, nhưng ĐKVĐ Hà Nội đã thua trực tiếp PVF 0-1. Thầy trò HLV Dương Hồng Sơn ngậm ngùi chia tay với sân chơi đã 4 lần vô địch trong 5 năm qua. Do PVF là chủ nhà của VCK và đứng đầu bảng A nên U.19 Viettel (á quân 2016, 4 lần hạng 3), cũng bị loại vì không nằm trong 3 đội nhì bảng có thành tích tốt nhất.