Viện Hàn lâm Khoa học xã hội Việt Nam còn 26 đơn vị trực thuộc
Chính phủ ban hành Nghị định số 32/2025 quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Viện Hàn lâm Khoa học xã hội Việt Nam và có hiệu lực từ ngày 1/3/2025.
Theo đó, về tổ chức bộ máy, Viện Hàn lâm Khoa học xã hội Việt Nam phối hợp với Bộ Khoa học và Công nghệ trình Chính phủ quyết định thành lập mới, tổ chức lại, giải thể, đổi tên các tổ chức, đơn vị trực thuộc Viện theo quy định của pháp luật.
Cơ cấu tổ chức Viện Hàn lâm Khoa học xã hội Việt Nam, theo Nghị định gồm 26 đơn vị gồm:
1. Ban Tổ chức - Cán bộ; 2. Ban Tài chính và Quản lý khoa học; 3. Ban Hợp tác quốc tế; 4. Văn phòng; 5. Viện Nhà nước và Pháp luật; 6. Viện Triết học; 7. Viện Nghiên cứu Con người, Gia đình và Giới;

Trụ sở Viện Hàn lâm Khoa học xã hội Việt Nam.
8. Viện Nghiên cứu Văn hóa; 9. Viện Dân tộc học và Tôn giáo học; 10. Viện Sử học; 11. Viện Văn học; 12. Viện Ngôn ngữ học; 13. Viện Xã hội học và Tâm lý học; 14. Viện Nghiên cứu Châu Á - Thái Bình Dương; 15. Viện Nghiên cứu Nam Á, Tây Á và Châu Phi;
16. Viện Nghiên cứu Châu Âu và Châu Mỹ; 17. Viện Kinh tế Việt Nam và Thế giới; 18. Viện Địa lý nhân văn và Phát triển bền vững; 19. Viện Khoa học xã hội vùng Trung Bộ và Tây Nguyên; 20. Viện Khoa học xã hội vùng Nam Bộ;
21. Viện Khảo cổ học; 22. Viện Nghiên cứu Hán – Nôm; 23. Viện Thông tin Khoa học xã hội; 24. Bảo tàng Dân tộc học Việt Nam; 25. Học viện Khoa học xã hội; 26. Nhà xuất bản và Tạp chí Khoa học xã hội.
Chủ tịch Viện Hàn lâm Khoa học xã hội Việt Nam quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của các đơn vị thuộc và trực thuộc.
Viện Hàn lâm Khoa học xã hội Việt Nam có Chủ tịch và không quá 4 Phó Chủ tịch. Chủ tịch và các Phó Chủ tịch Viện Hàn lâm Khoa học xã hội Việt Nam do Thủ tướng Chính phủ bổ nhiệm, miễn nhiệm và chịu trách nhiệm trước Chính phủ, Thủ tướng Chính phủ và trước pháp luật về toàn bộ hoạt động của Viện.