Trước tình hình mưa lũ nghiêm trọng do hoàn lưu bão số 11 gây ra tại các tỉnh Cao Bằng, Lạng Sơn, Thái Nguyên và nhiều địa phương miền núi phía Bắc, giao thông đường bộ bị chia cắt, nhiều khu vực bị cô lập và ngập sâu, Tổng công ty Quản lý bay Việt Nam (VATM) đã khẩn trương chỉ đạo các đơn vị trực thuộc, đặc biệt là Công ty Quản lý bay miền Bắc, phối hợp chặt chẽ với Quân chủng Phòng không - Không quân trong công tác bảo đảm điều hành bay an toàn tuyệt đối cho các chuyến bay cứu trợ nhân đạo.
Hoạt động điều hành bay cứu trợ nhân đạo khẳng định năng lực của Quản lý bay bảo đảm an toàn tuyệt đối cho mọi chuyến bay trong bất kỳ hoàn cảnh nào.
Trong điều kiện mưa lớn, mây thấp và tầm nhìn hạn chế, Tổng công ty Quản lý bay VN đã phối hợp chặt chẽ với lực lượng không quân, đảm bảo an toàn tuyệt đối 14 chuyến bay cứu trợ hàng hóa, nhu yếu phẩm đến những khu vực bị chia cắt do bão lũ.
Trong điều kiện địa hình bị ngập sâu và thời tiết xấu tại khu vực phía Bắc, nhiều chuyến bay buộc phải thả hàng từ trên không và các đơn vị bay đã phối hợp đảm bảo chính xác, an toàn tuyệt đối.
Ảnh hưởng của bão Matmo sáng 7/10 khiến năng lực tiếp thu máy bay tại Nội Bài có lúc giảm xuống chỉ còn 5 chuyến/giờ, gần 20 chuyến bay bị ảnh hưởng.
Tổng cộng đã có 17 chuyến bay phải bay chờ do ảnh hưởng thời tiết trong vùng kiểm soát của Trung tâm Kiểm soát đường dài Hà Nội (ACC Hà Nội) và Trung tâm Kiểm soát tiếp cận (APP Nội Bài).
Theo thông tin từ Tổng công ty Quản lý bay Việt Nam (VATM), ngay từ khi tại sân bay Nội Bài có mưa dông trong đêm và sáng 7/10, Trung tâm Quản lý luồng không lưu đã tổ chức họp để ra quyết định điều tiết luồng không lưu.
Do ảnh hưởng của mưa dông kéo dài trong ngày 7/10, tại Cảng HKQT Nội Bài khiến 17 chuyến bay phải bay chờ và 1 chuyến bay phải chuyển hướng sang sân bay dự bị.
Sau khi nghe thấy tiếng nổ lớn từ máy bay vừa cất cánh, kiểm soát viên không lưu tại sân bay Nội Bài (Hà Nội) đã yêu cầu cơ trưởng cho máy bay quay lại để hạ cánh khẩn cấp. Chuyến bay sau đó hạ cánh an toàn, được khắc phục hư hỏng và khởi hành trở lại. Cục trưởng Cục Hàng không đã có thư khen nhân viên kíp trực.
Ngay sau khi máy bay Malindo Air (Malaysia) cất cánh, kiểm soát viên không lưu nghe thấy tiếng nổ, nghi ngờ máy bay bị nổ lốp và sau đó đã hiệp đồng các đơn vị để máy bay hạ cánh an toàn.