Hệ thống các công trình thủy lợi trên địa bàn Hà Nội bị ô nhiễm nghiêm trọng có nguyên nhân chủ yếu đến từ việc nguồn nước bị xâm phạm. Xả thải tràn lan và không phép là những hành vi chính dẫn đến tình trạng này.