Phân hiệu Thanh thiếu niên Việt Nam tại TPHCM có chức năng, nhiệm vụ đào tạo, bồi dưỡng cán bộ Đoàn, Đội, Hội của Trung ương Đoàn tại các tỉnh, thành phía Nam, với các bậc đào tạo: trình độ sau đại học, đại học, cao đẳng và trung cấp theo quy định của Bộ Giáo dục - Đào tạo và Học viện Thanh thiếu niên Việt Nam.