Bắc Ninh có hệ thống thủy lợi đa dạng gồm đê điều, hồ chứa, đập dâng, kênh mương… Các công trình được thiết kế theo hướng đa mục tiêu vừa ngăn lũ, phòng, chống thiên tai và tích trữ nước phục vụ sản xuất, điều hòa môi trường, vừa kết hợp phát triển hạ tầng giao thông, là động lực thúc đẩy phát triển kinh tế - xã hội.
Trong những năm qua, các mô hình nuôi cá lồng trên sông ở Bắc Ninh phát triển mạnh mẽ, mang lại hiệu quả kinh tế cao do tận dụng điều kiện tự nhiên thuận lợi cùng thế mạnh có nhiều dòng sông nước ngọt chảy qua. Tuy nhiên, các mô hình nuôi cá lồng tại Bắc Ninh còn gặp nhiều khó khăn trong việc mở rộng sản xuất đại trà.