Phân khu đô thị sông Hồng trải dọc qua 11 quận, huyện của Hà Nội, được chia thành 3 khu chức năng từ R1 đến R5. Hiện, nhiều nơi trong bản quy hoạch vẫn là bãi đất trống.
Theo quy hoạch, sông Hồng là tuyến vận tải đường thủy cấp I, II, đoạn qua khu quy hoạch bố trí 6 cảng đường thủy nội địa gồm: 2 cảng chính Hà Nội và Khuyến Lương; 4 cảng địa phương Chèm - Thượng Cát, Bắc Hà Nội, Thanh Trì và cảng Bát Tràng.