Trong thời gian gần đây, cơ quan chức năng TP Nha Trang, tỉnh Khánh Hòa đã tổ chức kiểm tra và liên tục phát hiện các đơn vị doanh nghiệp xây dựng công trình, xâm lấn vịnh Nha Trang. Điều này, cho thấy công tác bảo vệ vịnh Nha Trang đứng trước nhiều khó khăn, thách thức và cần được quan tâm hơn nữa.
Trong khi triển khai cải tạo mặt bằng xây dựng Khu du lịch sinh thái Trí Nguyên (đảo Hòn Miễu thuộc phân khu phát triển Khu bảo tồn biển vịnh Nha Trang), Công ty TNHH Du lịch Trí Nguyên - Nha Trang đã ngang nhiên chặt phá một diện tích lớn rừng nguyên sinh, đào xới, san ủi đất đá tràn ra triền núi, xuống biển, gây ảnh hưởng nghiêm trọng đến môi trường vịnh Nha Trang…