Theo kết luận của Thanh tra Chính phủ, công tác cổ phần hóa diễn ra tại Tổng Công ty Đường sắt Việt Nam – TNHH MTV có nhiều vi phạm và trách nhiệm thuộc Ban chỉ đạo cổ phần hóa, Tổng công ty Đường sắt Việt Nam cùng các đơn vị thành viên và Bộ GTVT.